Setelah merasa cukup ilmu belajar di Tanah Air, Kiai Bisri Syansuri lantas pergi ke Tanah Suci Makkah. Di sana, dia kembali mendalami ilmu agama Islam dengan sejumlah ulama terkemuka yang ada saat itu.
Guru-guru agamanya di Makkah antara lain Syekh Muhammad Baqir, Syekh Muhammad Said Al Yamani, Syekh Umar Bajened, Syekh Muhammad Sholeh Bafadlol, Syekh Abdullah, Syekh Ibrahim Al Madani, dan Syekh Jamal Maliki.
Dengan Syekh Ahmad Khatib Padang, Syekh Syuaib Doghestani, dan Kiai Mahfudz Termas juga dia sempat berguru.